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單細(xì)胞多組學(xué)如何運(yùn)用到臨床及藥物研發(fā)?

從2012年,北京尋因生物創(chuàng)始人李宗文博士就進(jìn)入NGS檢測(cè)領(lǐng)域工作。從科研到臨床,李宗文博士見證了新技術(shù)的迭代!靶录夹g(shù)的開發(fā)應(yīng)用是一個(gè)令人興奮的過程”,單細(xì)胞測(cè)序的崛起吸引了李宗文博士的目光,2018年,他和自己曾經(jīng)的同事一起創(chuàng)立了尋因生物。

尋因生物是一家自主研發(fā)單細(xì)胞技術(shù)的精準(zhǔn)醫(yī)療生物醫(yī)藥企業(yè),擁有國內(nèi)獨(dú)家微孔芯片與油包水雙技術(shù)平臺(tái),致力于通過國產(chǎn)高通量單細(xì)胞全鏈條產(chǎn)品及服務(wù),將單細(xì)胞技術(shù)普適化,應(yīng)用于臨床及藥物研發(fā),助力相關(guān)疾病研究。

目前尋因已與百余家科研院所、醫(yī)療機(jī)構(gòu)、制藥企業(yè)開展深度合作,實(shí)現(xiàn)了商業(yè)運(yùn)營。

微孔芯片平臺(tái)的核心產(chǎn)品是SeekOne MM高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組試劑盒,該試劑盒無需昂貴的硬件配套,操作較為簡單直觀。運(yùn)用獨(dú)特的核酸標(biāo)記技術(shù)可以保證更少的平衡文庫依賴,且雙標(biāo)系統(tǒng)確保結(jié)果精確。實(shí)驗(yàn)表明,其千級(jí)細(xì)胞的雙細(xì)胞率低至0.7%。

9月份即將推出的油包水檢測(cè)平臺(tái)的產(chǎn)品是SeekOne DD油包水儀器,通過該儀器的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)需經(jīng)過4個(gè)步驟:

1. 首先將單細(xì)胞懸液放入雙十字交叉型微芯片,形成包含細(xì)胞、Gel Beads以及試劑的微液滴。

2. 經(jīng)過幾分鐘后,微液滴內(nèi)細(xì)胞裂解,Barcode序列釋放,標(biāo)記細(xì)胞的不同組學(xué)信息,并逆轉(zhuǎn)錄包含Barcode和UMI片段在內(nèi)的cDNA。

3. 當(dāng)油滴破碎后,以cDNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增、建庫,并進(jìn)行二代測(cè)序(NGS)。

4. 最后,通過生物信息學(xué)的方法,并根據(jù)Barcode和UMI,從測(cè)序數(shù)據(jù)中拆分出完整的單細(xì)胞組學(xué)信息。

除產(chǎn)品外,尋因還可提供全國上門解離服務(wù)。經(jīng)驗(yàn)豐富的解離團(tuán)隊(duì)運(yùn)用自主研發(fā)的樣本解離儀和解離液,為客戶提供高成功率的解離服務(wù)。目前,尋因生物可以完成100多種組織單細(xì)胞懸液制備,包含神經(jīng)系統(tǒng)、循環(huán)系統(tǒng)、運(yùn)動(dòng)系統(tǒng)、內(nèi)分泌系統(tǒng)、泌尿系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)、生殖系統(tǒng)、消化系統(tǒng)等。

根據(jù)自主研發(fā)的可視化云平臺(tái)與試劑盒、儀器配套化信息分析軟件,與專有數(shù)據(jù)庫、阿里云彈性計(jì)算結(jié)合,為客戶提供個(gè)性化分析方案,滿足自主操作應(yīng)用分析需求。

經(jīng)過分析評(píng)估,尋因質(zhì)控基本分析軟件與10xcellranger分析性能評(píng)估結(jié)果細(xì)胞一致率>99%,RNA expression相關(guān)性>0.99,細(xì)胞聚類tSNE結(jié)果高度一致,細(xì)胞聚類結(jié)果在相同cluster的一致率>99%。

尋因生物通過科研及臨床服務(wù)積累數(shù)據(jù)資源,并結(jié)合科研成果及公共數(shù)據(jù)庫提供深度解讀。目前已有300余項(xiàng)研究,細(xì)胞數(shù)據(jù)100多項(xiàng),細(xì)胞標(biāo)記1萬余個(gè)。

此外,其可視化云計(jì)算平臺(tái)與單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫、自動(dòng)化注釋軟件的配合可以解決單細(xì)胞分析的瓶頸——細(xì)胞類型注釋。操作簡便,可實(shí)現(xiàn)拖拽式自定義分析流程與輸出可視化報(bào)告。

“在數(shù)據(jù)基礎(chǔ)解析過程中,耗時(shí)是比較長的,因此我們做了流程優(yōu)化和系統(tǒng)改造,從而將信息分析流程控制在8個(gè)小時(shí)內(nèi)!崩钭谖牟┦勘硎。

經(jīng)透露,今年3月份尋因生物進(jìn)入商業(yè)化階段,4個(gè)月的時(shí)間里,團(tuán)隊(duì)從20人發(fā)展至130人規(guī)模,營收也超過了千萬元。為科研機(jī)構(gòu)提供解決方案是營收的主要來源,此外還與醫(yī)院醫(yī)生合作,推動(dòng)臨床轉(zhuǎn)化。

當(dāng)前尋因生物的產(chǎn)品管線是圍繞單細(xì)胞SeekOne為基礎(chǔ),未來公司將推出新的檢測(cè)產(chǎn)品,并圍繞臨床業(yè)務(wù)進(jìn)行技術(shù)開發(fā)!坝捎谀壳皢渭(xì)胞測(cè)序的單價(jià)較高,覆蓋群體并不廣泛,因此尋因生物還將圍繞一二線核心城市進(jìn)行市場布局與拓展。”李宗文博士透露。

在融資方面,尋因生物已完成過億元A輪融資,由博遠(yuǎn)資本領(lǐng)投,辰德資本跟投。據(jù)悉,尋因生物近期已啟動(dòng)新一輪融資。

本文文章頭圖來源于尋因生物,經(jīng)授權(quán)使用。本文為創(chuàng)業(yè)邦原創(chuàng),未經(jīng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載,否則創(chuàng)業(yè)邦將保留向其追究法律責(zé)任的權(quán)利。                                   

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