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中山六院:個(gè)性化診療,冰冷手術(shù)臺(tái)上的數(shù)據(jù)溫度

2021-12-13 14:35
來(lái)源: 粵訊

醫(yī)療的背后,是對(duì)生命的探索,是對(duì)人與自然關(guān)系的把握。”

《深度醫(yī)療》的譯者后記中這樣寫(xiě)道。

中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院(以下簡(jiǎn)稱“中山六院”)結(jié)直腸外科手術(shù)室,患者小王(化名)正在接受一場(chǎng)有“大數(shù)據(jù)”助診的手術(shù)。

在這之前不久,年僅28歲的小王被診斷超低位直腸癌,腫瘤下緣距離肛門齒狀線僅2厘米,腫瘤縱徑有5厘米,并且已浸潤(rùn)穿透腸壁全層,直腸系膜多發(fā)可疑轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)。按照常規(guī)治療模式,小王需要切除肛門,終生與造口相伴。此外,小王還需要接受術(shù)前輔助放化療,放療給盆腔帶來(lái)的放射性損傷將不可避免地將損傷他的生育功能。

如何在手術(shù)的根治性和術(shù)后的生活質(zhì)量之間找到最佳平衡點(diǎn)?

中山六院結(jié)直腸肛門外科吳小劍主任醫(yī)師團(tuán)隊(duì)為小王制定了新的輔助治療方案,在強(qiáng)化藥物治療,爭(zhēng)取最大程度縮瘤效果的同時(shí)避免放療損傷。與此同時(shí),吳小劍團(tuán)隊(duì)將前期開(kāi)發(fā)的“直腸癌新輔助治療療效深度學(xué)習(xí)預(yù)測(cè)人工智能(AI)模型”用于評(píng)估患者療效。如術(shù)前預(yù)測(cè),術(shù)后小王腫瘤療效評(píng)估0級(jí),也就是顯微鏡下未見(jiàn)腫瘤細(xì)胞殘留。

世界上沒(méi)有兩片樹(shù)葉是相同的,在同樣的疾病面前,每位患者都是獨(dú)立而不同的個(gè)體。如何通過(guò)個(gè)人醫(yī)療數(shù)據(jù)的復(fù)雜全景圖優(yōu)化臨床醫(yī)療決策?大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)醫(yī)療已經(jīng)提上日程。

個(gè)性化診療漸行漸近

臨床中普遍使用“一刀切”或循證醫(yī)學(xué)的模式為大多數(shù)患者設(shè)計(jì)一種治療措施,但患者個(gè)體的基因、環(huán)境和生活方式是千差萬(wàn)別的。同樣的治療方法對(duì)一部分患者有效,但對(duì)另外一部分患者卻可能無(wú)效。

中山六院:個(gè)性化診療,冰冷手術(shù)臺(tái)上的數(shù)據(jù)溫度

中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院副研究員、計(jì)算腫瘤學(xué)博士高峰

“在醫(yī)學(xué)診療上,醫(yī)生如果可以多一個(gè)依據(jù)去做更好的判斷,只要比隨機(jī)亂猜好那么一點(diǎn),就是很大的進(jìn)步。不要讓病人試錯(cuò),這就是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)需要做的。”中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院副研究員、計(jì)算腫瘤學(xué)博士高峰在采訪中表示。

美國(guó)科學(xué)院醫(yī)學(xué)研究所的一項(xiàng)調(diào)研顯示,目前美國(guó)臨床中使用的治療方法,就有30%無(wú)效甚至有害,每年浪費(fèi)醫(yī)療資源8600億美元。

減少誤診和過(guò)度醫(yī)療操作對(duì)于患者來(lái)說(shuō)同樣重要。我們常聽(tīng)說(shuō)的靶向藥其實(shí)就屬于精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的范疇內(nèi)。靶向藥物能瞄準(zhǔn)特定的病變部位,并在目標(biāo)部位蓄積或釋放有效成分,在提高藥效的同時(shí)抑制毒副作用,減少對(duì)正常組織、細(xì)胞的傷害。

精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)也被稱為“數(shù)字醫(yī)學(xué)”,是一個(gè)建立在了解個(gè)體基因、環(huán)境和生活方式基礎(chǔ)上的新型疾病治療和預(yù)防方法。它是以個(gè)體化醫(yī)療為基礎(chǔ),隨著基因組測(cè)序、生物信息與大數(shù)據(jù)、云計(jì)算等前沿科技的交叉應(yīng)用而發(fā)展起來(lái)的新型醫(yī)學(xué)概念與醫(yī)療方式。

“只有數(shù)字化才能成為真正的資源”

電影《我不是藥神》讓很多人知道了被白血病患者尊為活命神藥的格列衛(wèi)。之所以成為“神藥”,是因?yàn)槲覀円呀?jīng)確定了慢性髓性白血病很大一部分是因?yàn)橘M(fèi)城染色體變異導(dǎo)致的,而格列衛(wèi)可以治愈90%以上!暗蟛糠帜[瘤我們還不知道到底是怎么回事,所以沒(méi)辦法完全治愈他!备叻逭f(shuō)。

世界衛(wèi)生組織國(guó)際癌癥研究署(IARC)發(fā)布的2020年全球最新癌癥負(fù)擔(dān)數(shù)據(jù),結(jié)直腸癌是全球范圍內(nèi)發(fā)病率排名第三(2020年新增病例193萬(wàn))、致死率排名第二(2020年新增死亡病例94萬(wàn))的癌癥類型。結(jié)直腸癌可能發(fā)生在任何年齡,近30年來(lái),50歲以下的年輕人群中結(jié)直腸癌的發(fā)病率持續(xù)攀升,及早發(fā)現(xiàn)、診斷,以及的手術(shù)根治性和術(shù)后生活質(zhì)量對(duì)于治療結(jié)直腸癌來(lái)說(shuō)尤為重要。

“我們不可能消滅腫瘤,但醫(yī)學(xué)技術(shù)的進(jìn)步可以讓我們把腫瘤變成慢性病。就像糖尿病一樣,雖然用胰島素不方便,但不會(huì)影響大家的生存!案叻逭f(shuō)。

如今,中山六院正在不斷探索以精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)為代表的新醫(yī)學(xué)模式,將大數(shù)據(jù)、人工智能等數(shù)字技術(shù)引入醫(yī)療領(lǐng)域,通過(guò)數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng),尋找更好的治療方案。

“只有數(shù)字化才能成為真正的資源!北究茖W(xué)計(jì)算機(jī),博士攻讀醫(yī)學(xué)專業(yè)的高峰更深諳數(shù)字驅(qū)動(dòng)現(xiàn)代醫(yī)療的意義,“通過(guò)真實(shí)世界樣本剖析腫瘤的分子異質(zhì)性是實(shí)現(xiàn)個(gè)體化治療的必要手段,但現(xiàn)行臨床數(shù)據(jù)庫(kù)不能很好的記錄分子特征,而生物樣本庫(kù)存儲(chǔ)的組織、血液、糞便樣本的流通性、可訪問(wèn)性、可復(fù)用性都是問(wèn)題。”

中山六院基于浪潮分布式存儲(chǔ)平臺(tái)構(gòu)建了癌癥數(shù)字化生命資源庫(kù)。通過(guò)整合來(lái)自高通量檢測(cè)手段的多組學(xué)數(shù)據(jù)和醫(yī)療信息系統(tǒng)中的結(jié)構(gòu)化病歷、數(shù)字病理、醫(yī)學(xué)影像,實(shí)現(xiàn)現(xiàn)有臨床資源數(shù)字化,做到“有數(shù)有據(jù)”;基于數(shù)字化的生物醫(yī)學(xué)資源構(gòu)建大數(shù)據(jù)圖譜、開(kāi)發(fā)醫(yī)學(xué)人工智能 實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)知識(shí)化,提供輔助精準(zhǔn)診療手段;通過(guò)“互聯(lián)網(wǎng)+”醫(yī)院將先進(jìn)的AI輔助診療技術(shù)下沉到基層,提高醫(yī)療質(zhì)量。大數(shù)據(jù)、人工智能技術(shù)在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用,幫助腫瘤患者獲得個(gè)性化治療方案。全程數(shù)字化讓這一切成為可能。

中山六院:個(gè)性化診療,冰冷手術(shù)臺(tái)上的數(shù)據(jù)溫度

中山六院基于大數(shù)據(jù)平臺(tái)推進(jìn)精準(zhǔn)醫(yī)療

不管修路,只管開(kāi)車

全程數(shù)字化意味著,真實(shí)世界之外需要建立一個(gè)基于數(shù)據(jù)的虛擬現(xiàn)實(shí)。

除了存在醫(yī)院PACS系統(tǒng)里的傳統(tǒng)的CT、核磁影像,在腫瘤這個(gè)領(lǐng)域還會(huì)有基因檢測(cè)數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)、分析,在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,這些數(shù)據(jù)會(huì)成為醫(yī)學(xué)研究和臨床的重要支撐。

數(shù)據(jù)量大、性能高是醫(yī)療大數(shù)據(jù)研究的突出特征。一次高精度影像檢測(cè)數(shù)據(jù)量高達(dá)10G以上,一次基因檢測(cè)產(chǎn)生100GB海量數(shù)據(jù)。人類基因組包含30億個(gè)堿基對(duì),即使是對(duì)人體局部部位進(jìn)行測(cè)序,大樣本的批量處理也會(huì)帶來(lái)極高的性能需求。

以結(jié)直腸癌測(cè)序?yàn)槔,要?duì)2000對(duì)4000例(每個(gè)患者測(cè)一個(gè)正常組織和一個(gè)癌變組織)的測(cè)序數(shù)據(jù)完成一次全基因組測(cè)序,基于目前醫(yī)療機(jī)構(gòu)現(xiàn)有的設(shè)施需要耗費(fèi)長(zhǎng)達(dá)數(shù)年的時(shí)間。這就需要構(gòu)建一個(gè)性能強(qiáng)大、穩(wěn)定可靠的醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái),支撐起生命醫(yī)學(xué)全生命周期的研究。

“我們的訴求首先是基因數(shù)據(jù)的安全保證,同時(shí)還要在保證連續(xù)讀寫(xiě)性能的情況下快速做分析!备叻灞硎尽

中山六院:個(gè)性化診療,冰冷手術(shù)臺(tái)上的數(shù)據(jù)溫度

浪潮存儲(chǔ)

中山六院的醫(yī)療信息數(shù)據(jù)與多組學(xué)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)系統(tǒng)架構(gòu)將數(shù)據(jù)分析存儲(chǔ)和數(shù)據(jù)歸檔存儲(chǔ)分離。其中,數(shù)據(jù)分析存儲(chǔ)采用高性能的AS13000G5-H存儲(chǔ),每節(jié)點(diǎn)配置36塊14TB SATA硬盤(pán),搭載BeeGFS文件系統(tǒng),并行存儲(chǔ)系統(tǒng)可提供15GB/s帶寬; 數(shù)據(jù)歸檔存儲(chǔ)采用高吞吐的浪潮AS13000G5-M36存儲(chǔ),每節(jié)點(diǎn)配置5塊1.92TB SSD硬盤(pán)和30塊14TB SATA硬盤(pán),搭載簡(jiǎn)潔高效的浪潮海量存儲(chǔ)軟件系統(tǒng)。

AS13000G5-H和M集群分別為前端計(jì)算節(jié)點(diǎn)提供獨(dú)立目錄,根據(jù)業(yè)務(wù)需要,指定數(shù)據(jù)存儲(chǔ)位置,不同層級(jí)存儲(chǔ)之間的數(shù)據(jù)遷移采用集群內(nèi)置工具完成。

這樣的分布式存儲(chǔ)架構(gòu)既能實(shí)現(xiàn)橫向擴(kuò)展,節(jié)點(diǎn)故障自動(dòng)切換,減少對(duì)上層業(yè)務(wù)的影響,也可以通過(guò)存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn)上數(shù)據(jù)均衡分布,提高系統(tǒng)的容量利用率。

對(duì)此,浪潮信息存儲(chǔ)產(chǎn)品線總經(jīng)理李輝表示:“平臺(tái)化是存儲(chǔ)產(chǎn)業(yè)大勢(shì)所趨!贝鎯(chǔ)平臺(tái)化,有利于存儲(chǔ)產(chǎn)品兼容并蓄,構(gòu)建起全面能力,針對(duì)不同場(chǎng)景進(jìn)行快速迭代和響應(yīng),從而真正發(fā)揮數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施的價(jià)值,釋放數(shù)據(jù)活力。

IDC預(yù)測(cè),2021年中國(guó)軟件定義存儲(chǔ)(SDS)市場(chǎng)增速將達(dá)到60.7%,2.4倍于中國(guó)存儲(chǔ)市場(chǎng)平均增速。面對(duì)快速增長(zhǎng)、復(fù)雜多元的新數(shù)據(jù)挑戰(zhàn),李輝表示:“下一步,我們會(huì)從產(chǎn)品上往解決方案轉(zhuǎn),圍繞數(shù)據(jù)從采集到銷毀的全生命周期做解決方案。我們最終還是希望用戶的精力和資源能夠從底層釋放出來(lái),把底層的事情交給我們這樣專業(yè)的廠商。用戶只需要專注在自己的業(yè)務(wù)層面,就像是我們?cè)诘缆飞贤ㄐ,就是‘不管修路,只管開(kāi)車’。”

李輝的底氣則來(lái)自于浪潮持續(xù)推進(jìn)智慧計(jì)算戰(zhàn)略,打造在算力、算法、數(shù)據(jù)三位一體的核心競(jìng)爭(zhēng)力,以及在分布式存儲(chǔ)領(lǐng)域加大的創(chuàng)新與投入。浪潮推出業(yè)界唯一以“一套架構(gòu)承載塊、文件、對(duì)象、大數(shù)據(jù)多種數(shù)據(jù)服務(wù)”的超大規(guī)模分布式存儲(chǔ)平臺(tái),浪潮AS13000以6,300,529 IOPS、0.781ms時(shí)延的評(píng)測(cè)值刷新了SPC-1全球分布式存儲(chǔ)性能最高記錄,產(chǎn)品技術(shù)達(dá)到國(guó)際領(lǐng)先水平。

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