騰訊「量子+AI」新藥研發(fā)版圖:多方合作,已申請多項專利
投資基礎研究,并與高校、企業(yè)合作解決真實問題。
分析師)羅賓
微信公眾號)yuanqicapital
近日,據(jù)智慧芽專利數(shù)據(jù)庫查詢顯示,騰訊公示了一項具新藥研發(fā)潛力的化合物“吡咯并三嗪類衍生物”分別向中國和全球申請的發(fā)明專利信息。
發(fā)明專利申請文件顯示,此項發(fā)明名稱為“吡咯并[2 ,1-f][1 ,2 ,4]三嗪類衍生物及其應用”,此項化合物對TTK有很強的抑制活性,可作為一類新穎的TTK抑制劑用于腫瘤的治療。
此外,9月,騰訊還公示了“分子結構的重建方法、裝置、設備、存儲介質及程序產(chǎn)品”的國內及全球發(fā)明專利申請。此申請的第一發(fā)明人為騰訊AI Lab高級研究員徐挺洋。
來源:智慧芽專利數(shù)據(jù)庫
據(jù)專利數(shù)據(jù)庫,騰訊申請的“吡咯并三嗪類衍生物”專利的發(fā)明人陳鑫德曾參與了中國科學院新藥研究國家重點實驗室、南京明德新藥研發(fā)有限公司(下稱“南京明德”)多項化合物結構專利申請(包括已授權發(fā)明專利),針對包括Lp-PLA2抑制劑、A2A受體抑制劑、選擇性HER2抑制劑等化合物結構及相關分子晶型及制備方法。南京明德為藥明康德的控股子公司。公開信息顯示,2018年至今,騰訊AI Lab徐挺洋參與或主導了多項發(fā)明專利的發(fā)明設計,針對的內容包括數(shù)據(jù)處理、模型訓練、藥物分析方法、預測分子標簽方法等。
另外,蘭州大學與騰訊共同于2021年2月分別申請了“胰高血糖素受體拮抗劑及其用途”和“預測拮抗劑的方法與裝置、拮抗劑、介質設備”兩項發(fā)明申請,發(fā)明人均包括了白啟峰、徐挺洋等7位人員。后一項專利申請?zhí)峁┝艘环N基于人工智能預測拮抗劑的方法與裝置、拮抗劑、介質和設備,所提出的技術方案能減少藥物研發(fā)的成本和時間。
白啟峰為蘭州大學基礎醫(yī)學院生物化學與分子生物學導師,主要從事糖尿病與心血管新藥藥學研究及新藥研究設計工作。
除最新披露的專利信息外,過去騰訊在化學及生物醫(yī)藥研發(fā)方面已經(jīng)有了一些成果。
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產(chǎn)學研合作成果發(fā)表于頂刊
在新藥研發(fā)領域,騰訊與高校、企業(yè)合作開展了一系列研究活動。生命科學與藥化是騰訊AI Lab及騰訊量子實驗室主要的應用方向之一,與高校的合作一方面保證了科研項目的人才穩(wěn)定、項目有潛在的應用價值,同時研究資金也更能更長期穩(wěn)定地持續(xù)。
騰訊AI Lab成立于2016年,團隊由世界知名院校的科學家及工程師組成。AI Lab與制藥、生命科學基礎研究領域開展合作,近年其團隊科研成果多次入選《Nature Communications》、ACL-IJCNLP等國際權威期刊。
2020年7月,騰訊AI Lab發(fā)布了首個AI驅動的藥物發(fā)現(xiàn)平臺“云深智藥”。基于AI Lab自主研發(fā)的深度學習算法、數(shù)據(jù)庫和云計算支持,此平臺能覆蓋臨床前新藥研發(fā)全部流程的五大模塊,包括蛋白質結構預測、虛擬篩選、分子設計/優(yōu)化、ADMET屬性預測及合成路線規(guī)劃。騰訊AI藥物發(fā)現(xiàn)平臺已與多家藥企合作,以驗證模型預測的精度。
2021年9月,成都先導公布與騰訊AI Lab展開AI在藥物研發(fā)領域合作,并共同設計開發(fā)了一款分子骨架躍遷新算法,今年3月,公司表示其第一階段的成果現(xiàn)已發(fā)表于ACS Omega。這也是“云深智藥”取得的一個突破性進展。此新算法有望加快藥物研發(fā)中的小分子設計環(huán)節(jié)。成都先導表示,基于AI技術的分子骨架躍遷系統(tǒng)已經(jīng)在其多個內外部藥物研發(fā)項目上進行應用,并在有些藥化項目上顯示出對研發(fā)效率的提升。
2022年4月,“云深智藥”發(fā)布了業(yè)內首個藥物AI大型分布外研究框架DrugOOD。DrugOOD針對藥物AI研究中最重要的活性預測問題,提供大規(guī)模、全面的藥物AI泛化數(shù)據(jù)集,覆蓋AI藥物輔助設計任務中發(fā)生分布偏移的各類場景。
2022年9月,騰訊AI Lab在國際學術期刊《Nature》子刊《Nature Machine Intelligence》中發(fā)布了針對單細胞轉錄組測序數(shù)據(jù)分析領域的scBERT模型,實現(xiàn)了高解釋性、高泛化性、高穩(wěn)定性的單細胞類型注釋技術,可用于臨床單細胞測序數(shù)據(jù)、輔助醫(yī)生更精準診斷或癌癥早篩,以及新藥臨床前研發(fā)的多種場景。
另外,為了支持基礎研究中的創(chuàng)新,騰訊籌備了“新基石研究員項目”并于今年7月1日至9月30日開放了首次的申報流程。騰訊公司在10年內將向該項目投入100億元,計劃支持200-300位科學家的科研項目,針對數(shù)理化生醫(yī)等基礎學科。據(jù)介紹,項目篩選出的研究員是某個領域最具原創(chuàng)性的科學家,且短期內有應用前景、有成果轉化可能的項目,都不在資助范圍內。
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「量子+AI」應用于新藥研發(fā)的階段性進展
除了與AI Lab實驗室合作,蘭州大學白啟峰所在團隊與騰訊量子實驗室聯(lián)合開發(fā)了自適應圖學習方法,預測分子相互作用及性質,其結果論文于2022年6月23日發(fā)表在了《Nature Machine Intelligence》。論文所提出的方法可以作為一種具有高適應性、性能、穩(wěn)健性和可解釋性的分子相互作用和性質的可靠方法,來幫助研究人員更高效地設計更好的藥物。
騰訊量子實驗室創(chuàng)立于2018年,專注于基礎研究、第一性原理模擬和量子算法,現(xiàn)已開發(fā)了材料研究和新藥研發(fā)等服務平臺,及TensorCircuit量子模擬等開源軟件框架。2021-2022年,量子實驗室共發(fā)表近50篇文章,其中超過15篇的影響因子大于10。
騰訊量子實驗室創(chuàng)作者及負責人張勝譽曾表示,量子實驗室的成果不只從數(shù)學和自然科學的角度去研究量子算法本身,還基于不同的行業(yè)中出現(xiàn)的真實問題去研究相應的量子理論和算法,因此這些學術研究結果今后會為行業(yè)應用打下基礎。
騰訊量子實驗室業(yè)務結構(來源:“騰訊量子實驗室”公眾號)
量子實驗室從量子AI入手,進入化學和藥物研發(fā)領域的研究。量子實驗室曾與外部科學家研發(fā)了第一個可證明的量子加速算法,并且在小分子藥物發(fā)現(xiàn)流程中引入了AI模型。兩種方法結合可以大大縮短藥物研發(fā)的時間,尤其是大幅減少所需要的合成的分子的數(shù)量。一款藥物如果能提前一段時間獲批上市,對企業(yè)來說商業(yè)價值很高。
化學問題是量子計算將來重要的應用場景之一;在醫(yī)學和新藥研發(fā)中,模擬計算將扮演化學家的試管一般的角色。例如蛋白質和設計出的小分子作用的過程可以用物理學第一性原理進行計算。
國際上不乏量子計算方法商業(yè)化的案例。由Schr?dinger參與投資創(chuàng)立的Nimbus Therapeutics,它的計算藥物發(fā)現(xiàn)引擎使其具有開發(fā)設計新型治療方法的潛力,專注于代謝紊亂、腫瘤和免疫等有著重疊生物學機制驅動的疾病領域。2016年,Nimbus將乙酰輔酶A羧化酶(非酒精性脂肪肝炎的抑制劑)項目出售給吉利德。今年10月又宣布了與禮來達成許可協(xié)議,合作開發(fā)和商業(yè)化針對可激活特定同種型AMPK的新型靶向療法。
騰訊企業(yè)發(fā)展事業(yè)群總經(jīng)理兼歐洲首席代表,也是騰訊量子技術投資的負責人葛凌表示,對于量子技術,她最看好的領域是藥物研發(fā)。騰訊等很多公司都在進行此方向的研究,如用量子算法預測蛋白質折疊或抗體結構,以尋求在癌癥、神經(jīng)系統(tǒng)疾病等方面的突破性療法。
張勝譽介紹,在新藥研發(fā)方面,量子實驗室推出了一些云服務,包括藥物虛篩服務,可從海量的小分子庫中快速篩選出與靶點蛋白緊密結合的候選藥物;成藥性分析服務,可為用戶提供藥物ADMET性質預測;以及耐藥性數(shù)據(jù)庫等。
而在藥物研發(fā)鏈條中很多機理不明確時,則需要借助AI來完成效率提升。藥明康德新藥研發(fā)服務部副總裁黎健曾表示,藥物化學家要面對多個目標優(yōu)化的問題,有些工作還無法用物理機理探明,例如靶點的作用機理并不清楚,這時,基于大量數(shù)據(jù)的AI分析可以得出相關性結論,幫助設計出虛擬分子。因為AI建立的模型可以淘汰掉不太符合相關性規(guī)律的候選虛擬分子。
本文由公眾號元氣資本(ID:yuanqicapital)原創(chuàng)撰寫,文中觀點僅供參考,不構成投資建議。
原文標題 : 騰訊「量子+AI」新藥研發(fā)版圖:多方合作,已申請多項專利
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