2020年5月29日，在深圳華大基因股份有限公司（以下簡稱華大基因，股票代碼300676．SZ）召開的“全景測序 防癌控癌——2020華大基因腫瘤技術(shù)成果研討與發(fā)布會”上，華大基因在線發(fā)布了三款腫瘤檢測技術(shù)：基于甲基化快速靶向測序EpiPlexTM的肝癌早檢技術(shù) 、同源重組缺陷（HRD）檢測技術(shù)（GSA）、實(shí)體瘤患者定制化監(jiān)測技術(shù)（Signatera），助力腫瘤的篩、診、監(jiān)的全景防控。

復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院副院長、肝臟外科主任周儉教授、復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院婦科主任吳小華教授，共同擔(dān)任此次大會主席；北京協(xié)和醫(yī)院婦科主任醫(yī)師吳鳴教授、復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院大腸外科主任醫(yī)師彭俊杰教授、華大基因腫瘤事業(yè)部負(fù)責(zé)人朱師達(dá)博士、華大數(shù)極生物科技（深圳）有限公司首席技術(shù)官汪宇盈博士、華大基因腫瘤研發(fā)技術(shù)負(fù)責(zé)人吳惠子博士分別分享了關(guān)于卵巢癌、腸癌、肝癌三個(gè)方向的國內(nèi)外研究、臨床治療進(jìn)展，及3款華大基因最新腫瘤檢測技術(shù)。華大基因大眾傳播部總監(jiān)項(xiàng)飛主持了此次大會。

惡性腫瘤（癌癥）已經(jīng)成為嚴(yán)重威脅中國人群健康的主要公共衛(wèi)生問題之一。癌癥預(yù)防分為三級，一級預(yù)防是病因預(yù)防，遠(yuǎn)離致癌危險(xiǎn)因素，減少發(fā)病機(jī)率。二級預(yù)防是對癌癥早發(fā)現(xiàn)，早診斷；三級預(yù)防是臨床標(biāo)準(zhǔn)化治療和康復(fù)治療，改善癌癥患者的預(yù)后和生活質(zhì)量。朱師達(dá)博士表示，華大基因堅(jiān)持在腫瘤基礎(chǔ)科研和臨床應(yīng)用方面不斷探索，在精準(zhǔn)腫瘤領(lǐng)域持續(xù)發(fā)力，此次發(fā)布的三款技術(shù)正是應(yīng)對腫瘤的早期診斷、用藥指導(dǎo)、復(fù)發(fā)監(jiān)測，助力腫瘤的全景防控。

技術(shù)1：尋癌變因子特征信號——基于甲基化高深度靶向測序的肝癌早檢技術(shù)

中國是一個(gè)肝癌大國。據(jù)統(tǒng)計(jì)，中國每年新增的肝癌患者約37萬［1］，約占全球新增肝癌患者的一半（95萬）［2］。肝癌是一種隱匿性發(fā)病的癌癥，早期臨床癥狀多不明顯，但是病情進(jìn)展迅速，整體五年生存率僅有18％。對肝癌高危人群的篩查和監(jiān)控，有助于肝癌早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早治療，是提高肝癌患者治療效果和生存率的關(guān)鍵。目前臨床常用的肝癌篩查手段是血清甲胎蛋白（AFP）檢測聯(lián)合肝臟超聲檢查，在一定程度上能夠有效的降低肝癌死亡率，但對早期肝癌的靈敏度和特異性不太理想（AFP檢測靈敏度25－65％，特異性80－94％；超聲檢查靈敏度51－78％，特異性80－100％）［3］，限制了其在肝癌早篩早診方面的應(yīng)用價(jià)值。

近年來， 腫瘤細(xì)胞壞死或凋亡過程中釋放至外周血中的DNA（Circulating tumor DNA，ctDNA）的發(fā)現(xiàn)為癌癥液體活檢技術(shù)的發(fā)展提供了基礎(chǔ)，同時(shí)也為癌癥早篩和早診提供了新的思路和方向。但是，ctDNA的信號常常淹沒在大量游離DNA（cell－free DNA，cfDNA）的背景中，因此，高效的新型檢測技術(shù)的開發(fā)和有效的分子標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)十分關(guān)鍵。

此次發(fā)布的由華大基因旗下子公司華大數(shù)極生物科技（深圳）有限公司（以下簡稱“華大數(shù)極”）開發(fā)的新型肝癌早檢技術(shù)，通過數(shù)極自主研發(fā)的甲基化快速靶向建庫測序技術(shù)（EpiPlexTM），對血液中游離DNA 中肝癌特異性CpG位點(diǎn)的甲基化狀態(tài)進(jìn)行單堿基分辨率的定量檢測。會上，華大數(shù)極首席技術(shù)官汪宇盈博士公開了多中心臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)，結(jié)果表明該技術(shù)對早期肝癌的檢測能達(dá)到89．5％靈敏度和93．7％的特異性。接下來，華大數(shù)極將進(jìn)一步擴(kuò)大臨床驗(yàn)證規(guī)模，并計(jì)劃開展前瞻性隊(duì)列研究以評估該技術(shù)的臨床應(yīng)用價(jià)值。

技術(shù)2：探基因組瘢痕奧秘——同源重組缺陷（HRD）檢測技術(shù)（GSA）

國家癌癥中心發(fā)布的中國2019最新癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)表明，中國每年卵巢癌新發(fā)病例約為5．21萬例，每年因卵巢癌死亡約2．25萬例［1］，由于大多數(shù)卵巢癌患者發(fā)現(xiàn)已經(jīng)是晚期，并且5年生存率不足30％，因此卵巢癌已經(jīng)成為女性最致命的惡性腫瘤之一。

卵巢癌的精準(zhǔn)靶向治療相對于其它腫瘤來說起步較晚，但隨著PARP抑制劑的問世給卵巢癌患者帶來了新的希望。2014年第一款PARP抑制劑奧拉帕利被FDA批準(zhǔn)用于胚系BRCA基因突變的晚期卵巢癌患者。隨后又有多個(gè)PARP抑制劑陸續(xù)獲批上市，極大地延長了卵巢癌患者的無鉑間期，提高了生存獲益，帶領(lǐng)卵巢癌治療真正邁進(jìn)了精準(zhǔn)維持治療時(shí)代。今年5月11日，F(xiàn)DA批準(zhǔn)了奧拉帕利聯(lián)合貝伐珠單抗用于HRD陽性人群一線維持治療的適應(yīng)癥。卵巢癌PARP抑制劑生物標(biāo)記物從BRCA基因拓展到了HRD狀態(tài)，這是一個(gè)質(zhì)的飛躍，意味著獲益人群將從20％左右擴(kuò)展到大約50％以上。

華大基因腫瘤事業(yè)部負(fù)責(zé)人朱師達(dá)博士提到，根據(jù)目前國內(nèi)外公認(rèn)的HRD檢測方法－－－ Genomic Scar法，華大基因基于中國人群的遺傳多態(tài)性數(shù)據(jù)，設(shè)計(jì)了一個(gè)涵蓋數(shù)十萬個(gè)單核苷酸多態(tài)性（SNP）位點(diǎn)，能夠覆蓋整個(gè)基因組的panel，并自主研發(fā)GSA （Genomic Scar Analysis）分析流程。該流程通過評估基因組雜合性缺失（Loss of heterozygosity，LOH）、端粒等位基因失平衡（Telomeric allelic imbalance，TAI）和大片段遷移（Large－scale state transitions，LST）這三項(xiàng)指標(biāo)計(jì)算HRD score，評估同源重組缺陷狀態(tài)。

朱師達(dá)博士還提到，GSA技術(shù)中至關(guān)重要的一個(gè)環(huán)節(jié)就是腫瘤純度和倍性的校正。因?yàn)槟[瘤細(xì)胞易發(fā)生染色體變異（即非整倍性），這種現(xiàn)象可在多個(gè)癌種患者的腫瘤細(xì)胞中都存在，其原因可能是由于腫瘤細(xì)胞中與有絲分裂相關(guān)的基因發(fā)生了突變，使染色體發(fā)生不均等分離，從而導(dǎo)致檢測出較多的CNV［4］。因此，在進(jìn)行HRD檢測分析過程中，需要針對個(gè)體患者進(jìn)行腫瘤純度和倍性的校正，使檢測結(jié)果更能真實(shí)反映患者的同源重組缺陷狀態(tài)，華大基因針對該環(huán)節(jié)進(jìn)行了相關(guān)驗(yàn)證，充分證實(shí)了華大自主開發(fā)GSA技術(shù)的科學(xué)性與準(zhǔn)確性。

技術(shù)3：察動態(tài)分子殘留——實(shí)體瘤患者定制化監(jiān)測技術(shù)（Signatera）

隨著科技和現(xiàn)有醫(yī)療技術(shù)的進(jìn)步，癌癥治療越來越趨向于精準(zhǔn)化治療，大部分患者能夠帶瘤生存。據(jù)統(tǒng)計(jì)，2015年之后，中國癌癥患者的5年生存率為36．9％ ［5］。針對這部分患者，急需一種長期有效的臨床手段對其疾病進(jìn)展進(jìn)行動態(tài)監(jiān)測。然而，現(xiàn)有的監(jiān)測方式，如腫瘤標(biāo)志物、CT掃描、核磁共振成像（MRI）、斷層掃描成像（PET）、鉬靶X線和X－光等，存在一定的局限性，特異性或敏感性較差，用于療效評估和復(fù)發(fā)監(jiān)測臨床效果欠佳，往往會使患者錯(cuò)失最佳治療時(shí)機(jī)。尤其是采用新型療法的患者，很難用傳統(tǒng)的影像學(xué)方法準(zhǔn)確評估其疾病進(jìn)展，如接受免疫治療的腫瘤患者中有2％－8％被報(bào)道存在假進(jìn)展［6］。而ctDNA半衰期短，敏感性高，能夠及時(shí)反映腫瘤的動態(tài)變化，并且與常見腫瘤標(biāo)志物相比，ctDNA監(jiān)測反映的疾病進(jìn)展與陽性影像結(jié)果具有更好的一致性［7］。

華大基因與美國Natera 公司強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合，開發(fā)了基于DNBSEQ測序原理的、針對實(shí)體瘤患者定制化監(jiān)測的Signatera 技術(shù)。該技術(shù)通過全外顯子測序技術(shù)（WES）對腫瘤組織和配對血細(xì)胞進(jìn)行全景檢測，然后結(jié)合超高深度液體活檢對患者的疾病進(jìn)行動態(tài)監(jiān)測，特定位點(diǎn)的有效測序深度超過30，000X，能有效檢測頻率 ＜ 0．1％的體細(xì)胞突變［9－10］， 具有高達(dá)99．5％的臨床特異性［8－12］，做到更早、更精準(zhǔn)的預(yù)測腫瘤復(fù)發(fā)和疾病進(jìn)展。

華大基因吳博士表示，在結(jié)直腸癌、乳腺癌、非小細(xì)胞肺癌和膀胱癌的臨床試驗(yàn)中，該技術(shù)相比影像學(xué)和腫瘤標(biāo)志物檢測，最早可提前24個(gè)月提示患者臨床復(fù)發(fā)［10－13］。Signatera技術(shù)不僅能夠檢測術(shù)后MRD狀態(tài)，還能全程監(jiān)測患者ctDNA動態(tài)變化，精準(zhǔn)預(yù)測疾病進(jìn)展，提早防范腫瘤復(fù)發(fā)，為醫(yī)生調(diào)整治療方案提供參考，也為患者接受最合適的治療爭取有效的窗口期。

復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院副院長、肝臟外科主任周儉教授：由于疫情的關(guān)系，醫(yī)療和公共衛(wèi)生成為了今年兩會的熱門議題之一。在今年的《政府工作報(bào)告》提到要實(shí)施癌癥防治行動，推進(jìn)預(yù)防篩查、早診早治和科研攻關(guān)，著力緩解民生的痛點(diǎn)。肝癌在我國癌癥發(fā)病率中排第四位，死亡率排第二位，疾病負(fù)擔(dān)重。如何建立肝癌早檢新技術(shù)、研發(fā)轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)預(yù)警新方案、克服肝癌異質(zhì)性制定個(gè)體化治療新策略，一直是我們中山醫(yī)院致力探索的方向。今天也很榮幸展示我們跟華大基因合作研發(fā)的甲基化液體活檢技術(shù)的成果，該技術(shù)可以高敏地檢測血液中游離DNA中肝癌特異性的、表觀基因組層面的異常信號，從而實(shí)現(xiàn)對早期肝癌的無創(chuàng)檢測；其檢測性能顯著優(yōu)于傳統(tǒng)的腫瘤標(biāo)志物。此外，我們也跟華大基因在實(shí)體瘤患者的定制化監(jiān)測技術(shù)展開了臨床合作。該技術(shù)針對腫瘤的患者治療期和治療后進(jìn)行全程監(jiān)測，具有非常廣泛的臨床應(yīng)用場景和很高的臨床特應(yīng)性和靈敏性。同時(shí)，我也了解到這個(gè)技術(shù)在Nature， Jama oncology， JCO等雜志發(fā)表了數(shù)據(jù)，有比較堅(jiān)實(shí)的臨床數(shù)據(jù)顯示其能比現(xiàn)有的影像學(xué)和腫瘤標(biāo)志物提前提示患者的臨床復(fù)發(fā)。我們期待，這些新技術(shù)能幫助推動中國癌癥患者的臨床診療方案進(jìn)步，為中國的癌癥患者帶來福音。

復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院婦科主任吳小華教授：去年10月，F(xiàn)DA批準(zhǔn)了尼拉帕利用于HRD陽性的三線或三線以上卵巢癌患者的維持治療；今年5月，F(xiàn)DA批準(zhǔn)了奧拉帕利聯(lián)合貝伐珠單抗用于HRD陽性的卵巢癌患者的一線維持治療。并且，今年最新公布的2020年V1版卵巢癌NCCN指南中提到，如果BRCA1／2基因檢測結(jié)果為陰性，HRD陽性可以作為PARP抑制劑一線維持治療的2B級證據(jù)。但是，目前國內(nèi)還沒有成熟的HRD檢測技術(shù)。如果能夠有一個(gè)基于中國人群的多態(tài)性特征來檢測HRD的技術(shù)，這對于國內(nèi)卵巢癌的精準(zhǔn)診治也是一個(gè)推進(jìn)，會給更多的患者帶來獲益。我們跟華大合作開展了HRD的臨床檢測項(xiàng)目，取得了較好的階段性成果。希望華大能夠探索到更適合中國人群的HRD檢測方法，并且這個(gè)方法是經(jīng)過中國人群測試和驗(yàn)證的，客觀反映中國人群的HRD狀態(tài)，在臨床上能夠給患者帶來更多的獲益。

北京協(xié)和醫(yī)院婦科主任醫(yī)師吳鳴教授：近期公布的一些臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)來看，像PAOLA－1、PRIMA臨床數(shù)據(jù)表明，除了BRCA1／2陽性的卵巢癌患者，HRD陽性也可以從PARP抑制劑的臨床治療中獲益。并且今年最新公布的2020年V1版卵巢癌NCCN指南中提到，如果BRCA1／2基因檢測結(jié)果為陰性，HRD陽性可以作為PARP抑制劑一線維持治療的證據(jù)。這說明HRD檢測對卵巢癌患者有重要的臨床指導(dǎo)意義。很高興看到華大基因在這方面已經(jīng)取得了很好的成果，期待這款技術(shù)為患者帶來更多的獲益。

復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院大腸外科主任醫(yī)師彭俊杰教授：對于早期腸癌，主要依靠外科手術(shù)進(jìn)行治療；對于II、III期腸癌，通常經(jīng)分層治療篩選高危患者接受輔助化療；對于相對低危的患者，可以對患者進(jìn)行觀察、隨訪或建議患者參加臨床研究。對于IV期腸癌則是通過放化療、靶向治療、手術(shù)治療等多種方案綜合進(jìn)行治療。 ctDNA作為液態(tài)活檢的重要部分，也是精準(zhǔn)醫(yī)療時(shí)代重要的武器，適合作為分子標(biāo)志物。ctDNA的主要應(yīng)用包含：早期診斷、分子分型、檢測微小殘留病灶、治療療效的動態(tài)監(jiān)測等方面，其檢測結(jié)果為臨床決策提供依據(jù)。從臨床實(shí)踐也可以看到，每一個(gè)腸癌患者的特征是不一樣的。很高興看到華大基因用WES結(jié)合ctDNA監(jiān)測的方法，為每一個(gè)患者提供獨(dú)特的監(jiān)測Panel，真正地邁向個(gè)體化醫(yī)療。

華大基因?qū)⒈�持“基因科技造福人類”的使命，繼續(xù)發(fā)揮自身在基因科技領(lǐng)域的優(yōu)勢，研發(fā)更多國際領(lǐng)先的技術(shù)，為精準(zhǔn)腫瘤診治提供全面解決方案，讓更多醫(yī)生和患者通過先進(jìn)技術(shù)獲益，為“健康中國2030”貢獻(xiàn)堅(jiān)實(shí)的自主科技力量助力。

專業(yè)名詞解釋：

靈敏度（Sensitivity，也稱為真陽性率）是指實(shí)際為陽性的樣本中，判斷為陽性的比例（例如真正患病人群中，被醫(yī)院判斷為有疾病者的比例）

特異度（Specificity，也稱為真陰性率）是指實(shí)際為陰性的樣本中，判斷為陰性的比例（例如真正沒有疾病的人群中，被醫(yī)院判斷為沒有疾病者的比例）

DNA甲基化：DNA化學(xué)修飾的一種形式，能在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現(xiàn)。為外遺傳編碼的一部分，是一種外遺傳機(jī)制。研究表明，癌癥的發(fā)生發(fā)展與DNA甲基化變異引起的基因表達(dá)調(diào)控異常有密切的聯(lián)系。

數(shù)據(jù)來源：

［1］《國家癌癥中心：中國2019癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)》

［2］ Fitzmaurice C， Abate D， et al． Global， Regional， and National Cancer Incidence， Mortality， Years of Life Lost， Years Lived With Disability， and Disability－Adjusted Life－Years for 29 Cancer Groups， 1990 to 2017： A Systematic Analysis for the Global Burden of Disease Study． JAMA Oncol． 2019；5（12）：1749‐1768．

［3］ Ayoub WS， Steggerda J， Yang JD， Kuo A， Sundaram V， Lu SC． Current status of hepatocellular carcinoma detection： screening strategies and novel biomarkers． Ther Adv Med Oncol． 2019；11（Special Collection）：1－14．

［4］ Feng， R．， Zong， Y．， Cao， S． et al． Current cancer situation in China： good or bad news from the 2018 Global Cancer Statistics？． Cancer Commun 39， 22 （2019）． https：／／doi．org／10．1186／s40880－019－0368－6」

［5］ CA Cancer J Clin． 2016 Mar－Apr；66（2）：115－32． doi： 10．3322／caac．21338． Epub 2016 Jan 25．

［6］ BorcomanE， NandikollaA， Long G， Goel S， Le Tourneau C． Patterns of response and progression to immunotherapy． In： ASCO Educational Book．Chicago， IL： American Society of Clinical Oncology； 2018．

［7］ SEN，S． Aneuploidy and cancer［J］． current opinion in oncology， 2000， 12（1）：82．

［8］LanmanRB， Mortimer SA， ZillOA， et al． Analytical and clinical validation of a digital sequencing panel for quantitative， highly accurate evaluation of cell－free circulating tumor DNA． PLoSOne． 2015；10（10）：e0140712． doi： 10．1371／journal．pone．0140712．

［9］PlagnolV， Woodhouse S， HowarthK， et al． Analytical validation of a next generation sequencing liquid biopsy assay for high sensitivity broad molecular profiling． PLoSOne． 2018；13（3）：e0193802． doi： 10．1371／journal． pone．0193802．

［10］Stetson D， Ahmed A， Xu X， et al． Orthogonal comparison of four plasma NGS tests with tumor suggests technical factors are a major source of assay discordance． JCO Precision Oncology． 2019；3：1－9． doi： 10．1200／PO．18．00191．

［11］SethiH， SalariR， SwenertonR， et al． Analytical validation of the Signatera? RUO assay， a highly sensitive patient－specific multiplex PCR NGS－based non－invasive cancer recurrence detection and therapy monitoring assay． In： Proceedings from the AACR Annual Meeting； April 14－18， 2018； Chicago， IL．Abstract 4542．

［12］Reinert T， Henriksen TV， Christensen E， et al． Analysis of plasma cell－free DNA by ultradeep sequencing in patients with stages I to III colorectal cancer ［published online ahead of print May 9， 2019］． JAMA Oncol． 2019． doi：10．1001／jamaoncol．2019．0528．

［13］Christensen E， Birkenskamp－DemtroderK， SethiH， et al． Early detection of metastatic relapse and monitoring of therapeutic efficacy by ultra－deep sequencing of plasma cell－free DNA in patients with urothelial bladder carcinoma ［published online ahead of print May 6， 2019］． J Clin Oncol． 2019． doi： 10．1200／JCO．18．02052．