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Science+Science子刊連發(fā),Complete Omics如何改變疾病早篩領(lǐng)域?

2021年3月1日,《科學(xué)》雜志和《科學(xué)-免疫學(xué)》雜志在線發(fā)表了來(lái)自約翰霍普金斯醫(yī)學(xué)院Bert Vogelstein 教授和美國(guó)臨床多組學(xué)分子診斷公司Complete Omics Inc.共同作者的兩項(xiàng)新突破。文章中闡述了一種新的腫瘤個(gè)體化診治的方法,分別針對(duì)抑癌基因TP53和原癌基因K-Ras上的個(gè)體化基因突變。 靶向這兩個(gè)非常重要的癌癥基因的個(gè)體化治療在歷經(jīng)多年的研究后,終于在近期有所突破。

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Bert Vogelstein教授和Complete Omics公司在實(shí)驗(yàn)中,首先通過(guò)基因檢測(cè)手段,確定了腫瘤相關(guān)基因突變,而后Complete Omics公司采用專利化的臨床蛋白組診斷平臺(tái)對(duì)個(gè)體化腫瘤治療靶點(diǎn)進(jìn)行鑒定和定量,找出最具潛在治療價(jià)值的腫瘤新抗原靶點(diǎn)。最后,根據(jù)相應(yīng)的多組學(xué)分子診斷結(jié)果,治療團(tuán)隊(duì)采用雙特異性抗體分別針對(duì)TP53蛋白和K-Ras蛋白的特定突變位點(diǎn)進(jìn)行靶向治療。

作為全球最知名的癌癥醫(yī)學(xué)科學(xué)家之一,Bert Vogelstein教授的大名自然不必多言。同時(shí),我們知道Vogelstein教授的高影響力的論文基本都是獨(dú)立完成,極少選擇與商業(yè)公司合作,Complete Omics這家初創(chuàng)企業(yè)有何背景,又希望如何改變?nèi)缃竦募膊≡绾Y領(lǐng)域?

一句“Anything hard”引發(fā)的創(chuàng)業(yè)經(jīng)歷

“多組學(xué)并不是幾種數(shù)據(jù)的疊加和綜合分析,因?yàn)楦鱾(gè)組學(xué)的深度、廣度、應(yīng)用場(chǎng)景以及數(shù)據(jù)的優(yōu)缺點(diǎn)各有不同。多組學(xué)臨床應(yīng)用是在深刻理解臨床需求和多種組學(xué)數(shù)據(jù)的自然屬性、切實(shí)進(jìn)行臨床組學(xué)技術(shù)的原創(chuàng)性研發(fā),以及深入理解疾病分子生物背景的基礎(chǔ)之上建立和形成的。從2008年以來(lái),我們一直專注于這個(gè)領(lǐng)域,積累了大量跨組學(xué)臨床數(shù)據(jù)和跨組學(xué)研發(fā)經(jīng)驗(yàn)。Complete Omics公司必將竭盡全力為世界范圍的患者和醫(yī)生開(kāi)發(fā)更多更好的技術(shù)!盋omplete Omics Inc創(chuàng)始人王磬博士說(shuō)。

王磬最早畢業(yè)于南開(kāi)大學(xué),獲分子生物學(xué)學(xué)士和碩士學(xué)位;2007年赴美繼續(xù)攻讀博士,在美國(guó)約翰霍普金斯醫(yī)學(xué)院,師從世界腫瘤學(xué)界泰斗Bert Vogelstein教授,也就是本次發(fā)表的兩篇論文的主要作者之一,獲藥理學(xué)博士學(xué)位。在攻讀博士期間,王磬同時(shí)還在約翰霍普金斯布隆博格公共衛(wèi)生學(xué)院獲得生物統(tǒng)計(jì)碩士學(xué)位。博士畢業(yè)后的王磬留在了美國(guó)約翰霍普金斯醫(yī)學(xué)院繼續(xù)進(jìn)行博士后研究,并隨后留校任教。目前,王磬在運(yùn)營(yíng)公司之余,還在世界著名的沃頓商學(xué)院MBA專業(yè)學(xué)習(xí)。

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左:Bert Vogelstein 教授;右:Complete Omics 創(chuàng)始人 王磬博士

Bert Vogelstein教授是享譽(yù)世界的癌癥遺傳學(xué)家,早在1980年代就系統(tǒng)闡述了基因突變引發(fā)癌癥的普遍規(guī)律,是TP53、APC、IDH1 等眾多癌癥基因相關(guān)研究的重要奠基人,論文總引用數(shù)超過(guò) 43 萬(wàn)次。

王磬在回憶自己博士求學(xué)經(jīng)歷的時(shí)候曾寫(xiě)到:“我仍然記得,第二次見(jiàn)Bert,他問(wèn)我想做什么項(xiàng)目的時(shí)候,我的回答是‘Anything hard.’現(xiàn)在想來(lái),真想為自己當(dāng)時(shí)的勇敢點(diǎn)個(gè)贊!闭沁@樣的勇敢,讓王磬走上了多組學(xué)診斷方法研究的道路,并在臨床基因組和臨床蛋白組相關(guān)的診斷領(lǐng)域?qū)矣袛孬@。

2019年,王磬辭去約翰霍普金斯醫(yī)學(xué)院腫瘤學(xué)系的教職,創(chuàng)辦Complete Omics公司,在創(chuàng)業(yè)之初就獲得了數(shù)百萬(wàn)美元的天使輪投資。Bert Vogelstein也大力支持自己學(xué)生的創(chuàng)業(yè)之路,出任Complete Omics的科學(xué)顧問(wèn)。

融合多組學(xué)技術(shù),解決早篩難題

目前為止的早篩技術(shù),雖然檢測(cè)的靶標(biāo)在不斷更新,尤其在癌癥領(lǐng)域,針對(duì)腫瘤基因相關(guān)突變、MSI、TMB、特定蛋白標(biāo)記物和代謝標(biāo)記物等不同靶標(biāo)的相關(guān)研究也不斷取得著突破性的進(jìn)展,但是近幾年的突破大多局限在單一組學(xué),尤其是基因組數(shù)據(jù)層面上,未能向外擴(kuò)張,與多組學(xué)技術(shù)相結(jié)合。同時(shí),一些國(guó)內(nèi)外市場(chǎng)上的 “多組學(xué)”技術(shù),往往是從早已商業(yè)化和標(biāo)準(zhǔn)化的平臺(tái)上采集幾種不同類型數(shù)據(jù)來(lái)進(jìn)行多元分析,甚或加上人工智能分析的標(biāo)簽,技術(shù)門檻較低,且并沒(méi)有出現(xiàn)實(shí)質(zhì)性的底層實(shí)驗(yàn)室技術(shù)方面的原創(chuàng)性突破,也沒(méi)有體現(xiàn)出對(duì)不同維度組學(xué)數(shù)據(jù)和不同臨床適應(yīng)性的深刻理解。

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王磬在Complete Omics的實(shí)驗(yàn)室工作

Complete Omics想要做的事情,就是打破分子診斷的邊界,通過(guò)實(shí)驗(yàn)室技術(shù)、儀器硬件平臺(tái)、和數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析方法這三方面硬科技的底層創(chuàng)新,將幾種數(shù)據(jù)類型的優(yōu)勢(shì)之處相互結(jié)合,形成包括臨床蛋白組分子診斷在內(nèi)的一系列多組學(xué)技術(shù)平臺(tái),將人類疾病診斷和健康篩查的靈敏度和準(zhǔn)確性推向新的高度。

Bert Vogelstein教授曾在幾年前創(chuàng)立Thrive Earlier Detection,一家液體活檢公司,通過(guò)檢測(cè)基因突變和蛋白變化來(lái)進(jìn)行早期癌癥篩查。在2018年發(fā)表的一篇論文中,Thrive Earlier Detection的CancerSEEK已經(jīng)在部分癌癥類型中表現(xiàn)出70%的敏感性中位數(shù)和超過(guò)99%的特異性。由于出色的研發(fā)進(jìn)展,Thrive Earlier Detection在2020年10月被癌癥早篩龍頭Exact Sciences以21.5億美元收購(gòu)。

從技術(shù)路徑上講,Complete Omics和Thrive Earlier Detection有些相似,切入的場(chǎng)景,也同樣以早期篩查為主。但是Complete Omics的宏圖看來(lái)更加遠(yuǎn)大,從泛癌種的癌癥早篩擴(kuò)張到了泛疾病領(lǐng)域早篩。

這讓Complete Omics的前景市場(chǎng)更大,開(kāi)發(fā)難度更高,但也讓他們有些前人的經(jīng)驗(yàn)可借鑒。在過(guò)去的兩年中,Complete Omics集中力量開(kāi)發(fā)了以“Complete360”為核心的臨床多組學(xué)平臺(tái)技術(shù),尤其是在臨床蛋白組領(lǐng)域取得了突破性的進(jìn)展。

目前“Complete360”已經(jīng)初步具備了面向患者的檢測(cè)能力,并推出了兩款核心LDT產(chǎn)品。一款檢測(cè)FDA已經(jīng)批準(zhǔn)用于13種不同疾病的194個(gè)生物標(biāo)志物;另一款則全面檢測(cè)血液中已發(fā)現(xiàn)與人類疾病相關(guān)的4550個(gè)蛋白以及協(xié)同檢測(cè)疾病相關(guān)基因突變,幫助診斷超過(guò)300種常見(jiàn)疾病。

這樣一來(lái),由現(xiàn)有的產(chǎn)品提供相對(duì)穩(wěn)定的經(jīng)營(yíng)收入,同時(shí)獲取臨床數(shù)據(jù),營(yíng)收資金還能用于推動(dòng)新產(chǎn)品的持續(xù)研發(fā),Complete Omics有能力在發(fā)展早期形成完整的商業(yè)閉環(huán)。

此次發(fā)表的兩篇文章則近一步鞏固了Complete Omics的臨床多組學(xué)平臺(tái)在世界范圍內(nèi)的領(lǐng)導(dǎo)地位,同時(shí)吸引了多家美國(guó)和歐洲的著名醫(yī)療服務(wù)和科研機(jī)構(gòu)同他們開(kāi)展臨床和科研服務(wù)合作。這些合作將會(huì)幫助Complete Omics完善在研的臨床多組學(xué)分子診斷平臺(tái),使得公司能夠近一步突出優(yōu)勢(shì),為患者和科學(xué)家提供更好的分子診斷服務(wù)。

本次發(fā)表的兩篇重磅文章,均由Complete Omics的技術(shù)平臺(tái)提供腫瘤多組學(xué)分子診斷支持。這也側(cè)面表現(xiàn)出該公司平臺(tái)目前已經(jīng)具備的世界領(lǐng)先的分子診斷實(shí)力和針對(duì)頂級(jí)期刊學(xué)術(shù)論文的科研支撐能力。王磬博士是其中一篇論文的共同通訊作者和另一篇論文的共同作者,并且Complete Omics的臨床蛋白組技術(shù)團(tuán)隊(duì)參與了這兩篇論文的發(fā)表和相關(guān)專利申請(qǐng),后續(xù)的成果轉(zhuǎn)化之路也將更加順利。

作者:郝翰

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