了解腫瘤微生物微環(huán)境
前言
腫瘤免疫治療的療效在很大程度上取決于腫瘤微環(huán)境,尤其是腫瘤免疫微環(huán)境。新的研究表明,微生物存在于腫瘤細(xì)胞和免疫細(xì)胞內(nèi),表明這些微生物可以影響腫瘤免疫微環(huán)境的狀態(tài)。
腫瘤微生物微環(huán)境在腫瘤免疫微環(huán)境中的作用是多方面的:可能作為免疫激活劑、抑制劑或旁觀者。潛在的機(jī)制包括:(I)癌細(xì)胞和免疫細(xì)胞呈遞微生物抗原,(II)微生物抗原模擬腫瘤抗原,(III)微生物誘導(dǎo)的免疫原性細(xì)胞死亡,(IV)由模式識(shí)別受體介導(dǎo)的微生物輔助性,(V)微生物衍生的代謝物,以及(VI)微生物對(duì)抑制性檢查點(diǎn)的刺激。
總的來(lái)說(shuō),腫瘤微生物微環(huán)境調(diào)節(jié)腫瘤免疫微環(huán)境,使其成為改善免疫治療的潛在靶點(diǎn)。這是一個(gè)面臨重大挑戰(zhàn)的新領(lǐng)域,值得進(jìn)一步探索。
腫瘤微生物微環(huán)境
人體容納著數(shù)萬(wàn)億的微生物,其中一些微生物有助于致癌或抗癌反應(yīng)。微生物,如細(xì)菌、真菌、病毒和支原體,存在于腫瘤組織內(nèi)。在癌細(xì)胞和腫瘤浸潤(rùn)性免疫細(xì)胞內(nèi)可以觀察到微生物的殘留物,如DNA、RNA、肽和細(xì)胞壁成分。一些微生物代謝物,包括脂肪酸和肌苷,可以在腫瘤內(nèi)積聚,并與癌細(xì)胞和免疫細(xì)胞上的受體結(jié)合。這些成分在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移和免疫反應(yīng)中都發(fā)揮作用,由它們形成的微環(huán)境不同于通常提到的腫瘤微環(huán)境,因此可作為一個(gè)新的類型,稱為“腫瘤微生物微環(huán)境”。
腫瘤微生物微環(huán)境具有臨床意義。首先,腫瘤內(nèi)微生物組具有腫瘤類型特異性和亞型特異性,有可能被用作診斷工具。例如,胰腺癌微生物組主要為變形菌門;而結(jié)直腸癌微生物組主要為厚壁菌門和變形菌門。其次,腫瘤組織的微生物組與正常組織的微生物組明顯不同,使其成為強(qiáng)大的治療靶點(diǎn)。某些微生物在腫瘤組織中特異性聚集,微生物被腫瘤吸引這一事實(shí)使這些微生物能夠被用作精確的抗癌藥物載體。第三,腫瘤微生物組在不同生存率的患者中是不同的,這使其成為一種潛在的預(yù)后工具。在胰腺癌中,與生存期短的患者相比,長(zhǎng)期存活患者的腫瘤微生物組具有更高的α多樣性和假黃單胞菌-鏈霉菌-糖多胞菌-克勞斯芽孢桿菌的特征。
腫瘤微生物微環(huán)境的作用機(jī)制
多項(xiàng)研究已經(jīng)觀察到腫瘤內(nèi)微生物與腫瘤微環(huán)境之間的相關(guān)性。最近的研究表明腫瘤微生物微環(huán)境作用于腫瘤微環(huán)境存在多種機(jī)制,包括:(I)癌細(xì)胞和免疫細(xì)胞呈遞細(xì)菌肽,(II)細(xì)菌抗原模擬腫瘤抗原(III)微生物誘導(dǎo)的免疫原性細(xì)胞死亡(IV)輔助模式識(shí)別受體介導(dǎo)的信號(hào)通路(V)微生物衍生代謝物(VI)刺激抑制性檢查點(diǎn)。
微生物抗原可能激活抗腫瘤T細(xì)胞
成功誘導(dǎo)適應(yīng)性抗腫瘤反應(yīng)需要兩個(gè)關(guān)鍵步驟。第一步是由人類白細(xì)胞抗原(HLA)呈遞腫瘤抗原以激活CD8+T細(xì)胞。第二步是激活的CD8+T細(xì)胞識(shí)別和殺死抗原特異性的癌細(xì)胞。然而,癌細(xì)胞可以通過(guò)多種機(jī)制向免疫細(xì)胞隱藏其抗原。
細(xì)菌肽在黑色素瘤轉(zhuǎn)移中普遍存在,它們可以通過(guò)黑色素瘤細(xì)胞和腫瘤浸潤(rùn)性免疫細(xì)胞上的HLA分子呈現(xiàn),證明其作為腫瘤特異性抗原的潛力。攜帶細(xì)菌肽HLA復(fù)合物的B細(xì)胞在體內(nèi)可激活腫瘤浸潤(rùn)性T細(xì)胞分泌IFN-γ,其他細(xì)菌肽也在多種黑色素瘤患者中普遍存在,此外,鑒于細(xì)菌肽是外源性的,與腫瘤抗原相比,它們更有可能觸發(fā)免疫反應(yīng)。
然而,細(xì)菌肽作為腫瘤特異性抗原仍然存在一些問(wèn)題。首先,正常組織中是否存在細(xì)菌肽尚不清楚,如果細(xì)菌肽也出現(xiàn)在正常組織中,那么這些組織將不可避免地受到攻擊。其次,癌細(xì)胞呈現(xiàn)的細(xì)菌肽在體內(nèi)沒(méi)有觸發(fā)有效的抗癌免疫,其根本原因尚不清楚。細(xì)菌肽、癌細(xì)胞和體內(nèi)免疫細(xì)胞之間的相互作用需要進(jìn)一步研究。
微生物抗原模擬激活抗腫瘤T細(xì)胞
抗原模擬是一種微生物與腫瘤抗原共享相似抗原表位的現(xiàn)象, 微生物特異性T細(xì)胞可以識(shí)別并殺死表達(dá)類似抗原表位的癌細(xì)胞。
Alexandra Snyder及其同事分析了不同預(yù)后的黑色素瘤患者的腫瘤新抗原表位。他們發(fā)現(xiàn)一些腫瘤新抗原表位與微生物表位同源,而且同源性越高,臨床預(yù)后越好。這一發(fā)現(xiàn)表明,抗原模擬存在于腫瘤中,并有可能影響免疫反應(yīng)。
Shin Heng Chiou及其同事分析了178例肺癌患者的77萬(wàn)條T細(xì)胞受體序列。他們發(fā)現(xiàn),與正常組織相比,腫瘤組織過(guò)表達(dá)了一種與EB病毒和大腸桿菌發(fā)生交叉反應(yīng)的蛋白質(zhì),這種而且交叉反應(yīng)存在于多個(gè)肺癌樣本中。未來(lái)有必要探索在各種類型的腫瘤中存在的微生物抗原模擬,這些“模擬抗原”可能為癌癥治療提供新的前景。
微生物誘導(dǎo)的免疫原性細(xì)胞死亡
免疫原性細(xì)胞死亡(ICD)是一種細(xì)胞死亡形式,死亡細(xì)胞釋放抗原和佐劑以增強(qiáng)免疫反應(yīng)。它可以由微生物觸發(fā),一些研究人員將細(xì)菌的空包膜和oxaliplatin結(jié)合起來(lái)治療晚期結(jié)直腸癌小鼠模型,聯(lián)合策略通過(guò)強(qiáng)化ICD強(qiáng)烈抑制腫瘤生長(zhǎng)并延長(zhǎng)小鼠的生存期。
溶瘤病毒或細(xì)菌特異性地定向于腫瘤微環(huán)境并溶解腫瘤細(xì)胞,從而釋放腫瘤抗原、損傷相關(guān)分子模式和病原體相關(guān)分子模式,以招募外周免疫細(xì)胞或重新啟動(dòng)已有的抗腫瘤免疫細(xì)胞。同時(shí),微生物本身可以作為一種很有前途的免疫佐劑來(lái)促進(jìn)炎性TME,從而進(jìn)一步增強(qiáng)抗腫瘤免疫。
輔助模式識(shí)別受體調(diào)節(jié)TME
微生物輔助性是指來(lái)源于微生物的病原體相關(guān)分子模式的免疫調(diào)節(jié)作用。病原體相關(guān)的分子模式可以通過(guò)模式識(shí)別受體(PRR)來(lái)感知,Toll樣受體(TLR)是研究最多的PRR亞型,TLRs的微生物激活在腫瘤免疫微環(huán)境中扮演著雙刃劍的角色。
首先,腫瘤內(nèi)微生物通過(guò)TLR驅(qū)動(dòng)免疫抑制腫瘤微環(huán)境的形成。在患有胰腺癌的小鼠模型中,腫瘤內(nèi)微生物選擇性激活單核細(xì)胞中的TLR,以誘導(dǎo)M2樣TAM分化。TLR4識(shí)別的細(xì)菌脂多糖誘導(dǎo)肝細(xì)胞表達(dá)CXCL1,CXCL1是一種趨化因子,可招募CXCR2+多形核MDSC形成免疫抑制環(huán)境,促進(jìn)小鼠膽管癌。類似地,TLR4識(shí)別的梭桿菌上調(diào)IL-6/p-STAT3/c-MYC信號(hào)通路,導(dǎo)致M2樣TAM極化和結(jié)直腸癌進(jìn)展。
另一方面,腫瘤內(nèi)微生物通過(guò)TLR維持免疫刺激性腫瘤微環(huán)境,因此充當(dāng)抗癌劑。在肺癌小鼠模型中,細(xì)菌脂蛋白激活TLR2,MDSCs被重新編程以分化為炎癥M1表型。此外,TLR激動(dòng)劑與IFN-γ協(xié)同作用,增加促炎細(xì)胞因子TNF-α、IL-12p40和IL-12p70,降低IL-10,形成炎癥微環(huán)境,激活抗腫瘤免疫反應(yīng)。
總的來(lái)說(shuō),微生物通過(guò)PRR調(diào)節(jié)腫瘤免疫微環(huán)境,一種特定的微生物可以同時(shí)與各種PRR相互作用,因此,微生物的免疫調(diào)節(jié)作用是許多不同PRRs介導(dǎo)的信號(hào)通路的總和。
微生物的衍生代謝物
微生物代謝產(chǎn)物如短鏈脂肪酸(SCFA)、膽汁酸和肌苷可進(jìn)入血液。一些微生物源性代謝產(chǎn)物的受體在癌細(xì)胞和腫瘤浸潤(rùn)的免疫細(xì)胞上表達(dá),表明微生物源性代謝產(chǎn)物在腫瘤微環(huán)境中的潛在作用。
SCFA是由腸道厭氧菌發(fā)酵的膳食纖維的產(chǎn)物,SCFA包括乙酸、丙酸和丁酸。對(duì)于正常的腸上皮細(xì)胞,SCFAs起到抑制促腫瘤炎癥的作用。例如,丁酸可以增加了腸道微環(huán)境中IL-10和維甲酸的水平,從而促進(jìn)了幼稚T細(xì)胞向調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的分化。此外,它還促進(jìn)調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的增殖,從而抑制促腫瘤炎癥。
次級(jí)膽汁酸,如ω-murocholic酸,下調(diào)肝竇內(nèi)皮細(xì)胞趨化因子CXCL16的分泌。因此,CXCR6-CXCL16相互作用招募的自然殺傷T細(xì)胞減少。抗生素可以消除微生物,逆轉(zhuǎn)上述效應(yīng)。目前的研究表明膽汁酸通過(guò)CXCL16-CXCR6調(diào)節(jié)自然殺傷細(xì)胞在肝癌的發(fā)生和發(fā)展中起著重要作用。
刺激抑制性檢查點(diǎn)
有核梭桿菌通過(guò)Fap2和TIGIT之間的相互作用或Fap2和CEACAM1之間的相互作用抑制自然殺傷細(xì)胞和細(xì)胞毒性T細(xì)胞的活性。幽門螺桿菌通過(guò)其外膜蛋白HopQ作用于CEACAM1,抑制免疫細(xì)胞。除了幽門螺桿菌和核梭桿菌外,其他細(xì)菌,如致病性奈瑟菌,也能與CEACAM1結(jié)合。
另一個(gè)檢查點(diǎn)CD47在腫瘤細(xì)胞表面表達(dá)。SIRPα是CD47的配體,在樹突狀細(xì)胞和巨噬細(xì)胞上表達(dá)。瘤內(nèi)注射抗生素清除了雙歧桿菌,降低了CD47阻斷的效果,表明雙歧桿菌可能是CD47阻斷的潛在佐劑。
腫瘤微生物微環(huán)境的臨床應(yīng)用
成功誘導(dǎo)抗腫瘤適應(yīng)性免疫應(yīng)答需要三個(gè)要素:抗原、佐劑和合適的免疫微環(huán)境。腫瘤微生物環(huán)境同時(shí)影響這三種元素,使其成為ICIs治療的一個(gè)有希望的組合。內(nèi)源性微生物調(diào)節(jié)的臨床策略包括抗生素和益生菌。外源性微生物調(diào)控利用合成生物學(xué)方法產(chǎn)生的微生物,如工程菌和溶瘤病毒。使用卡介苗(BCG)治療非肌肉浸潤(rùn)性膀胱癌以及使用溶瘤病毒talimogenelaherparepvec(T-VEC)治療晚期黑色素瘤是成功的腫瘤微生物微環(huán)境調(diào)節(jié)的兩個(gè)例子。
合成生物學(xué)
長(zhǎng)期以來(lái),微生物一直被用作可編程的藥物輸送平臺(tái)。最近,微生物被設(shè)計(jì)用來(lái)加強(qiáng)免疫治療。研究設(shè)計(jì)了一株非致病性大腸桿菌,以負(fù)載CD47納米抗體阻斷劑。該菌株在腫瘤內(nèi)定植并釋放CD47納米抗體阻斷劑,然后激活腫瘤浸潤(rùn)性T細(xì)胞以消除腫瘤。
另一種名為SYNB1891的工程化大腸桿菌菌株也采用了類似的策略。該菌株激活抗原呈遞細(xì)胞中的STING通路,從而增強(qiáng)癌細(xì)胞的吞噬作用。除了向腫瘤中添加免疫刺激微生物外,合成生物學(xué)還可以將免疫抑制微生物從腫瘤中移除。例如,有核梭桿菌特異性噬菌體和納米銀顆粒的復(fù)合物清除了腫瘤內(nèi)的有核梭桿菌,減少了腫瘤內(nèi)髓源性抑制細(xì)胞,增強(qiáng)了ICIs的功效。
抗生素和免疫檢查點(diǎn)抑制劑
臨床上,抗生素使用與ICIs治療的臨床結(jié)果呈負(fù)相關(guān)?股貙(duì)免疫治療的影響可以用抗生素介導(dǎo)的微生物調(diào)節(jié)來(lái)解釋。一方面,抗生素可引起微生物干擾,損害ICIs的療效。另一方面,抗生素可以清除化療誘導(dǎo)的有害微生物,從而提高ICIs的療效。因此,在臨床前實(shí)驗(yàn)和臨床試驗(yàn)中都需要監(jiān)測(cè)微生物的變化,以確認(rèn)微生物在抗生素和ICIs相互作用中的影響。
益生菌和免疫檢查點(diǎn)抑制劑
目前,正在進(jìn)行幾項(xiàng)將益生菌和ICIs相結(jié)合的臨床試驗(yàn)。已發(fā)現(xiàn)口服益生菌通過(guò)多效性機(jī)制恢復(fù)抗癌免疫和ICIs功效。然而,口服益生菌引起的腫瘤微生物微環(huán)境的變化尚不明確,因此需要在未來(lái)的臨床試驗(yàn)中檢測(cè)。
小結(jié)
總的來(lái)說(shuō),微生物,包括細(xì)菌、真菌、病毒及其成分和代謝物,存在于各種腫瘤組織中,形成腫瘤微生物微環(huán)境。目前的研究已經(jīng)揭示了一些微生物作為免疫激活劑、抑制劑或旁觀者的作用?紤]到腫瘤微生物微環(huán)境的多方面作用,其調(diào)節(jié)策略包括合成生物學(xué)、抗生素和益生菌可作為免疫治療的潛在組合。
腫瘤微生物微環(huán)境是一個(gè)面臨重大挑戰(zhàn)和機(jī)遇的新領(lǐng)域。全面了解腫瘤內(nèi)微生物及其在腫瘤免疫微環(huán)境中的作用將為研究腫瘤-免疫-微生物關(guān)系提供一個(gè)概念性轉(zhuǎn)變。腫瘤微生物組可能被用作一種預(yù)后或預(yù)測(cè)工具,這也可能有助于開發(fā)新的抗癌藥物。重要的是,它可能開啟下一波精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和免疫治療的組合策略。
參考文獻(xiàn):
1.The role of the tumor microbemicroenvironment in the tumor immune microenvironment: bystander, activator, orinhibitor? J Exp Clin Cancer Res. 2021; 40: 327.
原文標(biāo)題 : 了解腫瘤微生物微環(huán)境
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