侵權投訴
訂閱
糾錯
加入自媒體

ChIP+SIM看減數分裂過程中的RPA、RAD51、DMC1

之前我們整理分享過一系列關于減數分裂的文章,最近又上線一篇,將ChIP-seq、SIM超分辨兩大技術聯合使用,追蹤減數分裂中的關鍵事件DNA損傷修復,具體內容如下:

先搭建模型:減數分裂過程中,組蛋白甲基轉移酶PRDM9修飾組蛋白,“標記”損傷發(fā)生的位點,SPO11切割DNA,引發(fā)DNA雙鏈損傷(DSB)。DSB發(fā)生后RPA、DMC1、RAD51參與DSB修復,作者構建了一種雜交小鼠,可識別區(qū)分出小鼠兩條同源染色體(便于追蹤同源介導修復過程中的損傷染色體、模板染色體),利用ChIP-seq技術追蹤DSB修復過程中RPA、DMC1、RAD51在DNA序列上的分布情況

寬泛的看一下DSB數(SPO11指示)、RPA、DMC1、RAD51之間的關系,發(fā)現它們正相關

ChIP-seq數據發(fā)現損傷位點(SPO11指示)附近RPA、DMC1、RAD51有獨特的分布方式:DMC1、RPA聚集到損傷處,在損傷處密度最高,而RAD51圍著損傷處呈雙峰分布

DSB后的修復依賴同源染色體作為模板,作者搭建的系統(tǒng)可區(qū)分兩條同源染色體,即除了能看損傷鏈上RPA、DMC1、RAD51的分布外,還能看同源的模板鏈上RPA、DMC1、RAD51的分布,發(fā)現模板鏈上沒用DMC1、RAD51分布,有RPA分布

DMC1分布峰在損傷處,而RAD51分布峰距離損傷處較遠,暗示兩者并非完全共定位,作者實際用SIM超分辨進行了驗證,發(fā)現兩者的確只是部分共定位

1  2  下一頁>  
聲明: 本文由入駐維科號的作者撰寫,觀點僅代表作者本人,不代表OFweek立場。如有侵權或其他問題,請聯系舉報。

發(fā)表評論

0條評論,0人參與

請輸入評論內容...

請輸入評論/評論長度6~500個字

您提交的評論過于頻繁,請輸入驗證碼繼續(xù)

暫無評論

暫無評論

醫(yī)療科技 獵頭職位 更多
文章糾錯
x
*文字標題:
*糾錯內容:
聯系郵箱:
*驗 證 碼:

粵公網安備 44030502002758號