侵權(quán)投訴
訂閱
糾錯
加入自媒體

ChIP+SIM看減數(shù)分裂過程中的RPA、RAD51、DMC1

SIM做的很嚴謹,還互換了熒光標記又做了一遍

DMC1、RAD51看的差不多了,開始看RPA,在DSB初期RPA結(jié)合到DNA斷開處露出的單鏈DNA上,而后會被DMC1、RAD51取代(這兩個家伙介導單鏈DNA入侵同源雙鏈),進一步審視ChIP-seq數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)RPA覆蓋的區(qū)域恰好是DMC1和RAD51的總和 – 和已經(jīng)報道的結(jié)果一致

RPA會被DMC1、RAD51取代,這沒問題(以往的報道、作者的結(jié)果都說明了這一點),但被取代后RPA是否還會在DNA上待著并不清楚,作者比較了雄性小鼠常染色體及性染色體中的X染色體(Y比X短一截,因此X染色體有一部分可以說缺乏可以配對的同源染色體),可見,在X染色體上DMC1、RAD51隨損傷增加密度都增加,且增速高于常染色體,但RPA增速卻低于常染色體,暗示修復(fù)模板上存在RPA,X染色體因為有一部分缺乏配對的修復(fù)模板,造成RPA密度低了下來(前面的數(shù)據(jù)也看到了修復(fù)模板鏈上存在RPA)

作者從ChIP-seq數(shù)據(jù)中還發(fā)現(xiàn)RPA、DMC1、RAD51在損傷的DNA兩條單鏈上分布并不等量

RPA會結(jié)合損傷模板,看損傷鏈DMC1、RAD51和修復(fù)模板鏈RPA的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)DMC1峰對應(yīng)RPA峰,都在損傷位點附近,而RAD51分布在離損傷位點較遠的地方,且對應(yīng)的模板鏈上幾乎沒用RPA分布

最后來個模式圖:DMC1結(jié)合在靠近損傷的位置,RAD51挨著DMC1,兩者一起介導損傷鏈入侵同源模板鏈,同源模板鏈處有RPA結(jié)合穩(wěn)定同源介導修復(fù)中間體

挺好玩的一篇文章,把具備堿基分辨率的ChIP-seq技術(shù)和SIM超分辨技術(shù)一起使用,追蹤一個經(jīng)典的細胞行為 - DNA損傷修復(fù),復(fù)現(xiàn)前人結(jié)論,呈現(xiàn)一下觀察到的現(xiàn)象……

Anjali Gupta Hinch, Philipp W. Becker, Tao Li, et al. The Configuration of RPA, RAD51, andDMC1Binding in Meiosis Reveals the Nature of Critical Recombination Intermediates [J]. Molecular Cell , August 20, 2020.

此次文章交流會

主題:CNS前沿文獻追蹤 – 病毒衣殼在細菌內(nèi)部的運動模式

時間:9月17日 周四 19:00 - 20:00

主講人:于博士

參考文獻:

Kate McArthur, Lachlan W. Whitehead, JohnM. Heddleston, Lucy Li, et al. BAK/BAX macropores facilitate mitochondrialherniation and mtDNA efflux during apoptosis.[J]. Science, 23 February 2018.

<上一頁  1  2  
聲明: 本文由入駐維科號的作者撰寫,觀點僅代表作者本人,不代表OFweek立場。如有侵權(quán)或其他問題,請聯(lián)系舉報。

發(fā)表評論

0條評論,0人參與

請輸入評論內(nèi)容...

請輸入評論/評論長度6~500個字

您提交的評論過于頻繁,請輸入驗證碼繼續(xù)

暫無評論

暫無評論

醫(yī)療科技 獵頭職位 更多
文章糾錯
x
*文字標題:
*糾錯內(nèi)容:
聯(lián)系郵箱:
*驗 證 碼:

粵公網(wǎng)安備 44030502002758號