腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞可作為新的抗PD-1療效的泛癌預(yù)測(cè)生物標(biāo)志物
大家好,今天茶葉蛋和大家分享的是一篇13+分的學(xué)習(xí)筆記。
題目:腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞signature可作為一種新的抗PD-1/PD-L1療效的泛癌預(yù)測(cè)生物標(biāo)志物
一、研究背景
免疫治療的迅速發(fā)展為廣大癌癥患者帶來了福音,但目前被廣泛用于預(yù)測(cè)免疫治療療效的方法仍然只有基于PD-L1的免疫組化評(píng)估,在目前的臨床應(yīng)用中還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。在本篇學(xué)習(xí)筆記中提出了一個(gè)包括40個(gè)基因的腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞(TIL)signature評(píng)分,希望通過深入探究TIL評(píng)分以及其中包含的淋系和髓系評(píng)分在各類癌癥中的特征以及預(yù)后預(yù)測(cè)性能,為免疫治療相關(guān)分子標(biāo)記的進(jìn)一步的研究奠定基礎(chǔ)。
二、研究流程
三、結(jié)果解析
1.泛癌TCGA隊(duì)列中TIL以及淋系、髓系評(píng)分的特征
在本文中,TIL評(píng)分由4個(gè)10-gene signature組合而成,這4個(gè)signature分別被用作評(píng)估淋系、髓系、基質(zhì)和腫瘤細(xì)胞含量。根據(jù)腫瘤類型的不同,TIL評(píng)分為淋系+髓系兩項(xiàng)評(píng)分的組合或上述四項(xiàng)的組合。計(jì)算了TCGA泛癌隊(duì)列中32種癌癥類型的8975例患者的TIL評(píng)分之后,可發(fā)現(xiàn)評(píng)分在不同腫瘤類型之間存在差異(圖1A),而單獨(dú)對(duì)患者使用淋系評(píng)分(圖1B)和髓系評(píng)分(圖1C)的結(jié)果也顯現(xiàn)出各自不同的分布情況。
隨后,對(duì)TIL評(píng)分、淋系評(píng)分和髓系評(píng)分之間的相關(guān)性進(jìn)行探索(圖1D)。因?yàn)門CGA泛癌數(shù)據(jù)集還包含了代表性的HE染色圖像,使用人工智能軟件基于這些圖像對(duì)13種癌癥類型的3304例患者的TIL進(jìn)行了量化分析并將分析結(jié)果納入相關(guān)分析中。另外,還納入了TCGA中的另一個(gè)經(jīng)典評(píng)估變量——基于甲基化情況計(jì)算的白細(xì)胞評(píng)分。上述5個(gè)變量之間的相關(guān)矩陣顯示這些評(píng)估方法之間存在弱但顯著的相關(guān)性,且根據(jù)HE染色估算的TIL評(píng)分與淋系評(píng)分的相關(guān)性比與髓系評(píng)分的相關(guān)性高(圖1D)。上述結(jié)果提示基于基因signature的TIL評(píng)分是一種可以用來估計(jì)TCGA泛癌隊(duì)列中淋系和髓系兩種細(xì)胞含量的方法,而根據(jù)HE染色估算的TIL評(píng)分以及基于甲基化情況計(jì)算的白細(xì)胞評(píng)分可能更適合于研究淋系細(xì)胞的富集而非整體的免疫浸潤(rùn)情況。
圖1.A,B,C.TIL評(píng)分、淋系和髓系評(píng)分在TCGA泛癌隊(duì)列中的情況(數(shù)據(jù)經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)化);圖1D.基于HE染色的TIL評(píng)分、淋系評(píng)分、髓系評(píng)分、基于基因signature的TIL評(píng)分以及白細(xì)胞評(píng)分之間的相關(guān)情況
發(fā)表評(píng)論
請(qǐng)輸入評(píng)論內(nèi)容...
請(qǐng)輸入評(píng)論/評(píng)論長(zhǎng)度6~500個(gè)字
圖片新聞
-
金百澤科技亮相中國(guó)國(guó)際醫(yī)療器械博覽會(huì) | 盡顯醫(yī)療領(lǐng)域硬實(shí)力
-
進(jìn)階的新冠疫苗 又一個(gè)中國(guó)造
-
“AI醫(yī)療第一股”鷹瞳科技上市首日即破發(fā)
-
圓心科技登陸港股,“賣藥的生意”還好不好做?
-
十圖解讀2021年中國(guó)康復(fù)醫(yī)療行業(yè)現(xiàn)狀
-
醫(yī)藥流通數(shù)字化運(yùn)營(yíng)實(shí)現(xiàn)精細(xì)化飼養(yǎng)
-
科學(xué)家發(fā)現(xiàn)人體新器官:將有助于癌癥治療
-
李飛飛入選美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)院
最新活動(dòng)更多
-
11月19日立即報(bào)名>> 【線下論壇】華邦電子與恩智浦聯(lián)合技術(shù)論壇
-
11月29日立即預(yù)約>> 【上海線下】設(shè)計(jì),易如反掌—Creo 11發(fā)布巡展
-
即日-12.26火熱報(bào)名中>> OFweek2024中國(guó)智造CIO在線峰會(huì)
-
精彩回顧立即查看>> 2024(第五屆)全球數(shù)字經(jīng)濟(jì)產(chǎn)業(yè)大會(huì)暨展覽會(huì)
-
精彩回顧立即查看>> 全數(shù)會(huì)2024中國(guó)人形機(jī)器人技術(shù)創(chuàng)新發(fā)展大會(huì)
-
精彩回顧立即查看>> OFweek 2024中國(guó)激光產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展峰會(huì)
-
10 BD新浪潮
- 高級(jí)軟件工程師 廣東省/深圳市
- 自動(dòng)化高級(jí)工程師 廣東省/深圳市
- 光器件研發(fā)工程師 福建省/福州市
- 銷售總監(jiān)(光器件) 北京市/海淀區(qū)
- 激光器高級(jí)銷售經(jīng)理 上海市/虹口區(qū)
- 光器件物理工程師 北京市/海淀區(qū)
- 激光研發(fā)工程師 北京市/昌平區(qū)
- 技術(shù)專家 廣東省/江門市
- 封裝工程師 北京市/海淀區(qū)
- 結(jié)構(gòu)工程師 廣東省/深圳市