華為云EIHealth助力醫(yī)院發(fā)現(xiàn)肺癌靶向治療療效預(yù)測標(biāo)志物
近日,北京協(xié)和醫(yī)院臨床藥理中心研究團(tuán)隊(duì)聯(lián)合中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院內(nèi)科和華為云醫(yī)療智能體在《American Journal of Cancer Research》發(fā)表研究論文,發(fā)現(xiàn)晚期肺腺癌患者血清中的10種脂質(zhì)代謝物可有效預(yù)測表皮生長因子受體-酪氨酸激酶抑制劑(EGFR-TKI)治療的有效性。
鑒于具有EGFR基因敏感突變(mEGFR)的晚期肺腺癌患者接受EGFR-TKI治療后的無進(jìn)展生存時(shí)間(PFS)存在較大差異。因此,尋找能有效預(yù)測mEGFR肺腺癌患者治療效果的生物標(biāo)志物具有重要的臨床意義。
前期,中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院內(nèi)科研究團(tuán)隊(duì)對(duì)49名攜帶mEGFR晚期肺腺癌患者給予一代EGFR-TKI靶向治療,并收集患者組織和血漿樣本及臨床治療資料。其中25名患者預(yù)后PFS超過11個(gè)月,被歸為“療效好”組,24名患者預(yù)后PFS短于11個(gè)月,被歸為“療效差”組。
“療效好” vs. “療效差”
北京協(xié)和醫(yī)院臨床藥理研究中心團(tuán)隊(duì)對(duì)患者的血清和組織樣本展開了靶向代謝組學(xué)和二代靶向基因測序分析,經(jīng)單因素及多因素生存分析確定了4個(gè)與EGFR-TKI療效相關(guān)的基因,同時(shí)利用偏最小二乘回歸分析(PLS-DA)初步確定了療效相關(guān)的27個(gè)代謝物。進(jìn)一步結(jié)合華為云AutoGenome算法進(jìn)行AI建模鎖定了10種與療效相關(guān)的血清代謝物,包括神經(jīng)酰胺(Cers)、溶血磷脂酰膽堿(LPC)、溶血磷脂酰乙醇胺(LPE)、鞘磷脂(SM)和游離脂肪酸(FA),實(shí)現(xiàn)了對(duì)“療效好” vs. “療效差”的患者預(yù)測分類(AUC=0.85)。此外,采用最大流最小分割算法,在甘油磷脂代謝和鞘脂代謝途徑中觀察到4個(gè)突變基因與4個(gè)代謝物基因之間的調(diào)控關(guān)系網(wǎng)絡(luò)。
該研究表明,脂質(zhì)代謝和mEGFR基因同時(shí)突變與一代EGFR-TKI(鹽酸?颂婺幔┑寞熜嚓P(guān),為預(yù)測mEGFR肺腺癌患者的臨床反應(yīng)分類提供了新的視角,并揭示了非侵入性檢測血清代謝物在預(yù)測EGFR-TKI療效方面的潛力。
華為云醫(yī)療智能體EIHealth基于華為云AI昇騰集群服務(wù)、華為云一站式AI開發(fā)平臺(tái)ModelArts的強(qiáng)大AI能力,集成了醫(yī)藥領(lǐng)域眾多算法、工具、AI模型和自動(dòng)化流水線,目標(biāo)是打造一個(gè)全棧、開放、專業(yè)的醫(yī)療行業(yè)企業(yè)級(jí)AI研發(fā)平臺(tái)。
論文原文:
Han X, Luo R, Wang L, Zhang L, Wang T, Zhao Y, Xiao S, Qiao N, Xu C, Ding L, Zhang Z, Shi Y. Potential predictive value of serum targeted metabolites and concurrently mutated genes for EGFR-TKI therapeutic efficacy in lung adenocarcinoma patients with EGFR sensitizing mutations. Am J Cancer Res. 2020 Dec 1;10(12):4266-4286.
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