準(zhǔn)確預(yù)測(cè)SOFA分值!AI助力識(shí)別新冠危重癥患者病情變化|JIM
導(dǎo)讀
算法模型預(yù)測(cè)新冠危重癥患者病情變化的AUROC值為0.86;另外,借助算法模型對(duì)關(guān)鍵因素的“可解釋性”,或能深入了解新冠重癥患者病情進(jìn)展的病理生理機(jī)制。
近期,一篇發(fā)表在Journal of Intensive Medicine的論文表示,COVID-19(新型冠狀病毒肺炎)已成為全球最嚴(yán)重的突發(fā)公共衛(wèi)生事件之一,截至2021年9月底,全球報(bào)告的死亡人數(shù)已超過470萬,如何準(zhǔn)確識(shí)別新冠危重癥患者的病情變化對(duì)于優(yōu)化醫(yī)療資源分配、提高患者生存率至關(guān)重要。
在此背景下,研究人員使用機(jī)器學(xué)習(xí)算法構(gòu)建了預(yù)測(cè)模型,對(duì)入住ICU的新冠患者進(jìn)行SOFA(序貫器官衰竭評(píng)分)分值預(yù)測(cè)。結(jié)果顯示,預(yù)測(cè)模型的AUROC值為0.86,可有效預(yù)測(cè)危重癥患者的病情變化;另外,算法模型對(duì)關(guān)鍵因素的“可解釋性”,或能助力深入了解新冠重癥患者病情進(jìn)展的病理生理機(jī)制。
01
研究過程
兩個(gè)時(shí)間節(jié)點(diǎn)的SOFA分值比較
SOFA分值是評(píng)估危重癥患者病情的重要指標(biāo)。一項(xiàng)研究證明了SOFA與新冠患者微循環(huán)變化之間的聯(lián)系:只有SOFA<10分的患者才可通過增加毛細(xì)血管密度和血細(xì)胞比容來提升其氧攝取能力,而SOFA≥10的患者缺乏這種能力且具有較高水平的白細(xì)胞計(jì)數(shù);同時(shí)說明SOFA分值高、微循環(huán)系統(tǒng)損傷的新冠患者預(yù)后或更差。
危重癥患者的SOFA分值主要根據(jù)其PaO2/FIO2、血小板、膽紅素等變量數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算,這些數(shù)據(jù)一般來源于患者病歷,機(jī)器學(xué)習(xí)算法可從中識(shí)別相關(guān)聯(lián)的危險(xiǎn)因素進(jìn)行疾病預(yù)測(cè)。而在該研究中,研究人員選擇了XGBoost(極限梯度提升)算法進(jìn)行建模,這種機(jī)器學(xué)習(xí)算法不易過擬合、可解釋性高,在醫(yī)學(xué)預(yù)測(cè)任務(wù)中優(yōu)于其他算法。
研究人員從RISC-19-ICU注冊(cè)中心檢索到1613名新冠危重癥患者,根據(jù)膿毒癥3.0定義,患者SOFA分值增加≥2 分或減少≤ 2分可理解為病情惡化或改善,因此,研究人員在排除入院第1天或第5天SOFA評(píng)分缺失、以及兩個(gè)時(shí)間點(diǎn)之間SOFA分值變化≤1分的患者后,篩選了675名患者納入研究。這些患者入住ICU時(shí)或24小時(shí)內(nèi)的相關(guān)癥狀、實(shí)驗(yàn)室生理指標(biāo)被用作預(yù)測(cè)因子,結(jié)合入住第5天的數(shù)據(jù)分析出病情變化。
圖1 收集相關(guān)數(shù)據(jù)以及預(yù)測(cè)結(jié)果輸出的時(shí)間線
XGBoost算法的應(yīng)用過程包括數(shù)據(jù)集選擇、數(shù)據(jù)預(yù)處理、算法建模、性能評(píng)價(jià)四部分(圖2),研究人員在模型預(yù)測(cè)過程中,基于SOFA分值的變化,一旦識(shí)別到患者的病情惡化或改善,就會(huì)分析影響結(jié)果的相關(guān)變量的特征重要性。
圖2 算法建模及預(yù)測(cè)過程
02
結(jié)果評(píng)價(jià)
兩種算法模型性能及特征排序比較
由于這是一項(xiàng)回顧性研究,研究人員在算法模型輸出結(jié)果前,已對(duì)納入研究的675 名患者的實(shí)際SOFA分值、各項(xiàng)變量評(píng)分情況等信息進(jìn)行分析匯總。其中,有385名患者發(fā)生SOFA評(píng)分增加,290名患者SOFA評(píng)分降低,以此評(píng)價(jià)算法模型的性能及其可解釋性。
研究結(jié)果顯示,XGBoost模型準(zhǔn)確預(yù)測(cè)了320名患者(83%)的SOFA評(píng)分增加,210名患者(72%)的評(píng)分降低,平均ROC曲線下面積為0.86;并如預(yù)期的那樣,模型將Glasgow評(píng)分、休克狀態(tài)、血管加壓藥的使用、膽紅素濃度作為SOFA評(píng)分最相關(guān)的特征,而其他與患者預(yù)后相關(guān)的呼吸支持類型、APACHE II評(píng)分等特征也有助于準(zhǔn)確預(yù)測(cè)(圖3)。
圖3 XGBoost模型性能及影響結(jié)果的最重要特征
研究人員同時(shí)使用邏輯回歸這一傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)算法建模,以進(jìn)行兩種算法模型的性能評(píng)價(jià)。結(jié)果顯示,69%SOFA評(píng)分增加的患者、72%評(píng)分降低的患者被邏輯回歸模型準(zhǔn)確預(yù)測(cè),對(duì)應(yīng)的平均ROC曲線下面積為0.69。說明在預(yù)測(cè)任務(wù)上,XGBoost明顯優(yōu)于邏輯回歸算法。
值得一提的是,邏輯回歸模型判斷的最重要特征與XGBoost模型的差異較大,其中相同的僅有SAPS II評(píng)分、膽紅素濃度和入住ICU時(shí)去甲腎上腺素的使用這三個(gè)特征。
圖4 邏輯回歸模型性能及影響結(jié)果的最重要特征
研究人員認(rèn)為,基于XGBoost算法設(shè)計(jì)CDSS,可為臨床管理ICU患者病情提供決策支持。另外,該算法模型可解釋性高,能夠識(shí)別與COVID-19并發(fā)癥發(fā)展直接相關(guān)的因素,用于非ICU科室可幫助臨床預(yù)測(cè)患者發(fā)展成危重癥的可能性。但由于該研究缺乏非ICU數(shù)據(jù)集的驗(yàn)證,影響了對(duì)算法模型普適性的評(píng)價(jià),未來應(yīng)在真實(shí)臨床環(huán)境中進(jìn)一步驗(yàn)證。
參考材料:
Montomoli Jonathan, et al. Machine learning using the extreme gradient boosting (XGBoost) algorithm predicts 5-day delta of SOFA score at ICU admission in COVID-19 patients[J]. Journal of Intensive Medicine,2021,1(2):
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